主人公少年·新海春 获得了被伟大的意志引导的“App驱动”，并使来自“App芯片”的搜索App·GATCHIMON实体化了。隐藏在“App驱动”中的谜团，处在Appmon所潜藏的网络世界与现实世界之间的不可思议的“场”以及2只Appmon进化的“App合体”到底是什么？“利维坦”真正的目标究竟是……